Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps13P62301 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps13P62301 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms