Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppp1cbP62141 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppp1cbP62141 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms