Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ufm1P61961 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms