Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2iP60898 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2iP60898 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms