Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms