Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Csrnp1P59054 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms