Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdl3P58873 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhbdl3P58873 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhbdl3P58873 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl3P58873 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms