Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxbp1P58501 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms