Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms