Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf16P58334 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf16P58334 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf16P58334 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf16P58334 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf16P58334 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf16P58334 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf16P58334 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms