Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp4P57724 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcbp4P57724 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcbp4P57724 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms