Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NcstnP57716 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NcstnP57716 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms