Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp25P57080 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp25P57080 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp25P57080 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp25P57080 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp25P57080 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp25P57080 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.2 ms