Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bace1P56818 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bace1P56818 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bace1P56818 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms