Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctbp2P56546 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms