Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms