Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1P56183 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms