Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ephb3P54754 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms