Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PitpnbP53811 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PitpnbP53811 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PitpnbP53811 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms