Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PctpP53808 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PctpP53808 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PctpP53808 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PctpP53808 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PctpP53808 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PctpP53808 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PctpP53808 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PctpP53808 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PctpP53808 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms