Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CebpaP53566 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CebpaP53566 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpaP53566 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpaP53566 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpaP53566 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpaP53566 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms