Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efna1P52793 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efna1P52793 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efna1P52793 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna1P52793 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms