Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e3P52483 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms