Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClgnP52194 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClgnP52194 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClgnP52194 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ClgnP52194 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms