Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccr5P51682 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr5P51682 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms