Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr1P51675 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr1P51675 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms