Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XpcP51612 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XpcP51612 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XpcP51612 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XpcP51612 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XpcP51612 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XpcP51612 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XpcP51612 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XpcP51612 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XpcP51612 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XpcP51612 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XpcP51612 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XpcP51612 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XpcP51612 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XpcP51612 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XpcP51612 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XpcP51612 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XpcP51612 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XpcP51612 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms