Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SftpdP50404 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SftpdP50404 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms