Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdi1P50396 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms