Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdk5P49615 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms