Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrna7P49582 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms