Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc3P49135 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc3P49135 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc3P49135 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms