Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcd1P48410 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcd1P48410 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms