Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl11P48298 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl11P48298 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms