Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zic1P46684 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zic1P46684 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms