Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgavP43406 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms