Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlx1P43345 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms