Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nr2f2P43135 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr2f2P43135 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms