Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtgfrP43117 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms