Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NodalP43021 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NodalP43021 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NodalP43021 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NodalP43021 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NodalP43021 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NodalP43021 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NodalP43021 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NodalP43021 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NodalP43021 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NodalP43021 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NodalP43021 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NodalP43021 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NodalP43021 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NodalP43021 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NodalP43021 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NodalP43021 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms