Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LifrP42703 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LifrP42703 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LifrP42703 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LifrP42703 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LifrP42703 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LifrP42703 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LifrP42703 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LifrP42703 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LifrP42703 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LifrP42703 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LifrP42703 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LifrP42703 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LifrP42703 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LifrP42703 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LifrP42703 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LifrP42703 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LifrP42703 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LifrP42703 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LifrP42703 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LifrP42703 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LifrP42703 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LifrP42703 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LifrP42703 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LifrP42703 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LifrP42703 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LifrP42703 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms