Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx1-2P42580 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms