Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3caP42337 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3caP42337 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3caP42337 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms