Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elk1P41969 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elk1P41969 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms