Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf1P39428 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf1P39428 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf1P39428 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf1P39428 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf1P39428 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf1P39428 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms