Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig1P37913 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms