Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TpoP35419 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TpoP35419 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TpoP35419 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TpoP35419 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TpoP35419 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TpoP35419 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TpoP35419 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TpoP35419 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TpoP35419 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TpoP35419 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms