Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd22P35329 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd22P35329 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd22P35329 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd22P35329 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cd22P35329 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd22P35329 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms