Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stfa3P35173 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms