Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptk2P34152 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptk2P34152 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptk2P34152 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms